I Conselho Deliberativo: O Conselho Deliberativo é a instância  deliberativa do CONPED,  composto pela reunião de seus membros, de acordo com a lei 13.799 de 21 de dezembro de 2000.

II Mesa Diretora: A Mesa Diretora, de natureza colegiada e paritária, terá mandato de 2 (dois) anos, permitida a recondução por igual período, possuindo a seguinte composição:

I- Presidente;

II- Vice-Presidente;

III- 1º Secretário;

IV- 2º Secretário

Parágrafo único - Os componentes da Mesa Diretora serão eleitos, dentre os conselheiros titulares, por maioria dos votos da Plenária

III Comissões Temáticas Permanentes e  Grupos Temporários de Trabalho: As Comissões Temáticas Permanentes e  Grupos Temporários de Trabalho têm por finalidade subsidiar as decisões do Conselho Deliberativo e da Mesa Diretora no cumprimento de suas competências, quando solicitado.

IV Secretaria Executiva: A Secretaria Executiva é órgão de apoio técnico e administrativo, coordenada por um secretário executivo, composta por uma técnica e de apoio administrativo.